زمانی که یک موشک مرموز به کشتی VectorMans آسیب جدی وارد می کند، یک گشت معمولی با بارج لجن کوتاه می شود. وکتورمن از نابودی می گریزد و به زمین بازمی گردد و در حومه یک مرکز تحقیقاتی به ظاهر متروکه فرود می آید. همانطور که او شروع به تحقیق در مورد منبع موشک می کند، VectorMan یک گونه جهش یافته از حشرات را کشف می کند که در مرکز تحقیقاتی شروع به رشد کرده اند. بدتر از آن، حشرات تمایلات مخربی نسبت به سیاره از خود نشان می دهند و به نظر می رسد که توسط یک هوش نامرئی اداره می شوند. ماموریت VectorMans واضح است: حشرات جهش یافته را شکست دهید و یک بار دیگر زمین را از فاجعه قریب الوقوع نجات دهید.